由美里率领的反神经元组织维勒来到了被核化后完全染红的巴黎旧街市上空。为了让巴黎重回往日风貌，他们从战舰 AAA 温达的舰队中挑选出先锋队，将剩余王志文新剧的封印柱固定在巴黎地面。然而复原巴黎的操作时间只有 720 秒，紧张时刻神经元制造的新世纪福音战士正在大量接近。真理驾驶着新世纪福音战士改 8 号机前往迎击。而另一边，真嗣、明日香、绫波零正在赤红的陆王志文新剧地上前行，寻找 L 结界密度小的场所等待救援。在救援人员赶到后，他们来到了名为“第 3 村”的村落 —— 一个由经历了近第三次冲击的幸存者们建立的村落。真嗣目睹了渚薰在眼前死亡的场面，又因自己引发了近王志文新剧第三次冲击而感到愧疚，他封闭了自己，不吃不喝，同时也对外界的一切不为所动。